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SI,SIS,SIR,SEIRD模型

SI,SIS,SIR,SEIRD模型

因为个人工作需要系统地整理SI,SIR以及SEIR模型,故对三个模型进行原理介绍以及对比。文中关于SI,SIS,SIR的所有的截图都来自西工大肖华勇老师在慕课上的分享,原视频戳 这里。SEIRD模型则来自发表在SCI上的paper,想看原文戳这里。

SI model

作为比较古早的传染病模型(不对指数模型进行介绍),SI model在假设人口总数不变(不发生迁移,出生及死亡)的情况下,将人群分为易感人群S(suspectible)和病人I(Infective),在时刻

  1. t
  2. t
  3. t下,这两类人群的占比分别为
  4. s
  5. (
  6. t
  7. )
  8. s(t)
  9. s(t)和
  10. i
  11. (
  12. t
  13. )
  14. i(t)
  15. i(t),并假设病人每天有效接触的平均人数为
  16. λ
  17. \lambda
  18. λ。当I类人群与S类人群进行接触,S被感染,转为I类人群。

So,每个病人每天可以感染的人数为

  1. λ
  2. s
  3. (
  4. t
  5. )
  6. \lambda \cdot s(t)
  7. λ⋅s(t),共有
  8. N
  9. i
  10. (
  11. t
  12. )
  13. N \cdot i(t)
  14. Ni(t)个病人,故每天总感染人数为
  15. λ
  16. s
  17. (
  18. t
  19. )
  20. N
  21. i
  22. (
  23. t
  24. )
  25. \lambda \cdot s(t) N \cdot i(t)
  26. λ⋅s(t)Ni(t)

在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
由图3可得,SI模型中新增病人数量在

  1. i
  2. =
  3. 1
  4. /
  5. 2
  6. i=1/2
  7. i=1/2时增速最大,带入公式(6)可得
  8. t
  9. m
  10. t_m
  11. tm​为![在这里插入图片描述](https://img-blog.csdnimg.cn/f46d84c549fe4e0289dbaa337b987366.jpeg#pic_center)该模型适用于不可治愈传染病。

SIS model

和SI模型不同,SIS模型假设病人治好后变成健康者,健康者可以再次被感染成为病人。相比与SI模型, SIS模型增加条件为:每天被治愈的病人数占病人总数的比例为一个常数

  1. μ
  2. \mu
  3. μ,称
  4. μ
  5. \mu
  6. μ为**日治愈率**,病人治愈后仍可被感染。
  7. 1
  8. μ
  9. \frac{1}{\mu}
  10. μ1​为平均感染期。如
  11. μ
  12. =
  13. 0.2
  14. \mu = 0.2
  15. μ=0.2时,该疾病的日治愈率为
  16. 20
  17. %
  18. 20 \%
  19. 20%,平均感染期为5天。

在这里插入图片描述
得其增速曲线和函数曲线分别为
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述

  1. σ
  2. >
  3. 1
  4. \sigma>1
  5. σ>1代表每天传染的人数大于治愈的人数,
  6. σ
  7. 1
  8. \sigma \leq 1
  9. σ≤1则相反。SIS的模型曲线表明,当每天传染的人数大于治愈人数时(
  10. σ
  11. >
  12. 1
  13. \sigma>1
  14. σ>1),不论初始状态下病人的人数是否大于
  15. 1
  16. 1
  17. σ
  18. 1-\frac{1}{\sigma}
  19. 1−σ1​,最终感染的人数都趋于定值;当
  20. σ
  21. 1
  22. \sigma \leq 1
  23. σ≤1时,所有人都会被治愈。显而易见,
  24. σ
  25. \sigma
  26. σ在其中起关键作用。

SIR model

SIR考虑三种人群状态:S 类人群,易感人群;I 类人群,感染者;R 类人群,康复者,指的是感染者成功治愈,有免疫力的健康者。
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
由该图可得,SIR模型中病人最终全被治愈/移除,健康的易感者保持大于

  1. 5
  2. %
  3. 5\%
  4. 5%的比例。该图由matlab绘制,具体参数如下:

在这里插入图片描述
其中病人初始占比为0.1,易感者为0.9。
在这里要说明的是,大部分论文在使用SIR模型时,传染率和治愈率是呈1.5倍的关系,即传染率比治愈率等于1.5,而治愈率由图中的拓扑结构决定,与肖老师在PPT中所展示的图有所不同。所以大部分论文在使用SIR模型时,得出的结论是图中感染者的数量最终会达到一个稳定状态(如下图所示),即趋于定值。
在这里插入图片描述

SEIRD model

受新冠疫情的启发,相对于SIR模型,该模型多了潜伏期(E),死亡(D)。
在这里插入图片描述
参数

  1. γ
  2. \gamma
  3. γ反映了估计的病程时间,
  4. γ
  5. [
  6. 1
  7. 18
  8. ,
  9. 1
  10. 5
  11. ]
  12. \gamma \in [\frac{1}{18},\frac{1}{5}]
  13. γ∈[181​,51​]。

参数

  1. σ
  2. \sigma
  3. σ反映了该疾病的估计潜伏期,
  4. σ
  5. [
  6. 1
  7. 5
  8. ,
  9. 1
  10. 3
  11. ]
  12. \sigma\in[\frac{1}{5},\frac{1}{3}]
  13. σ∈[51​,31​].

参数

  1. β
  2. \beta
  3. β反映了感染者与他人互动的速率。它通常被写成
  4. β
  5. =
  6. R
  7. 0
  8. γ
  9. \beta =R_0 \gamma
  10. β=R0​γ,其中
  11. R
  12. 0
  13. R_0
  14. R0​称为基本复制数,表示疾病的传染速度。Liu等人(2020)回顾了关于covid-19r0估计的文献,得出结论,文献中的平均和中位数估计约为3,但 在最新的文献中,有人认为5.7更合理。

参数

  1. α
  2. \alpha
  3. α为infection fatality rateIFR)死亡率,一般情况下
  4. α
  5. \alpha
  6. α是变化的,在本文中作者认为
  7. α
  8. \alpha
  9. α为定值。

参数

  1. λ
  2. \lambda
  3. λ为真实报道中感染新冠病毒的人数占比,为定值。

模型初始化阶段为

  1. D
  2. (
  3. 0
  4. )
  5. =
  6. 0
  7. ,
  8. R
  9. (
  10. 0
  11. )
  12. =
  13. 0
  14. ,
  15. C
  16. (
  17. 0
  18. )
  19. =
  20. 0
  21. ,
  22. S
  23. (
  24. 0
  25. )
  26. =
  27. N
  28. E
  29. (
  30. 0
  31. )
  32. I
  33. (
  34. 0
  35. )
  36. R
  37. (
  38. 0
  39. )
  40. D
  41. (
  42. 0
  43. )
  44. =
  45. N
  46. E
  47. (
  48. 0
  49. )
  50. I
  51. (
  52. 0
  53. )
  54. D(0)=0,R(0)=0,C(0)=0,S(0)=N-E(0)-I(0)-R(0)-D(0)=N-E(0)-I(0)
  55. D(0)=0,R(0)=0,C(0)=0,S(0)=NE(0)−I(0)−R(0)−D(0)=NE(0)−I(0)。

本文转载自: https://blog.csdn.net/qq_37730871/article/details/126532308
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