2021.05.17【R语言】丨clusterProfiler注释表——KEGG/GO enrich富集图专用

摘要

刚开始接触项目的时候一直用公司搭建好的流程分析项目，慢慢学习后，发现有些地方的注释除了靠参考基因组相关的注释文档，还需要对应物种。在R中绘制KEGG.GO enrich富集图就需要根据物种来读取相应注释包，这里记录一份常用物种及对应注释包表，方便以后使用。

注释表
packagesorganismorg.Ag.eg.dbAnophelesorg.At.tair.dbArabidopsisorg.Bt.eg.dbBovineorg.Ce.eg.dbWormorg.Cf.eg.dbCanineorg.Dm.eg.dbFlyorg.Dr.eg.dbZebrafishorg.EcK12.eg.dbE coli strain K12org.EcSakai.eg.dbE coli strain Sakaiorg.Gg.eg.dbChickenorg.Hs.eg.dbHumanorg.Mm.eg.dbMouseorg.Mmu.eg.dbRhesusorg.Pf.plasmo.dbMalariaorg.Pt.eg.dbChimporg.Rn.eg.dbRatorg.Sc.sgd.dbYeastorg.Ss.eg.dbPigorg.Xl.eg.dbXenopus
一般咱们用的就是 org.Hs.eg.db和org.Mm.eg.db是比较常用的人和小鼠的注释包，注意，org.Mmu.eg.db是恒河猴（google翻译）的注释，不是老鼠，其他很多数据库会使用mmu代表老鼠，这里不是。