6月30日下午，贝瑞基因（000710.SZ）向外界公布了三代测序仪科研的最新进展：由公司参与完成的三代SMA（脊髓性肌萎缩症）临床回顾性研究成果，近期发表于分子诊断领域权威国际学术期刊 Journal of Molecular Diagnostics（即时IF=5.568）。此次研究证明，公司三代SMA相比qPCR、MLPA等传统检测方法，覆盖更全面，检测更精准。
就三代SMA的市场前景等，贝瑞基因董事长高扬接受钛媒体采访时表示：“可以看到SMA、CAH、地贫、FXS的单病发病风险并不高，但是在生育过程中，夫妻双方单个人携带的风险其实是很高的，所以这也是为什么携带者筛查的市场需求较大（的原因）。”
扩展性携带者筛查未来存在较大的市场空间。贝瑞基因市场总监赵智贤分析认为，2021年我国结婚登记人数763.6万对，扩展性携带者筛查平均市场单价按2000元／例计算，理论筛查比例按照产业筛查率达到65%推算，2021年理论扩展性携带者筛查市场容量预计高达198.5亿元。
SMA口服药堪称“天价”，携带者筛查尤为必要
据了解，此次三代SMA研究成果由中国福利会国际和平妇幼保健院与贝瑞基因联合发表，中国福利会国际和平妇幼保健院王彦林教授和贝瑞基因毛爱平博士为这项研究的通讯作者。
公开资料显示，SMA即脊髓性肌萎缩症（Spinal Muscular Atrophy），是一类由脊髓前角运动神经元变性导致肌无力和肌萎缩的遗传性肌肉疾病。SMA为婴幼儿中第二常见的致死性常染色体隐性遗传病，人群携带率为1/72-1/47，发病率为1/10000-1/6000。
虽携带率不算高，但一旦患上此病，只能修正治疗不能根治，且昂贵的治疗费用让诸多家庭望而却步。据山东省药械集中采购平台近日公告，SMA口服药利司扑兰主动申请降价，调整后价格为每瓶1.45万元。按年龄体重计算，价格调整后最大使用剂量患者年治疗费用将低于45万元。
显然，SMA携带者筛查才是降低该病种发病率的良方。据贝瑞基因三代事业部总监任志林介绍， SMA携带者分三种情况：91-94%的携带者只有一个正常功能的SMN1拷贝（1+0），2-5%的携带者含有两个SMN1拷贝，但其中一个包含致病点突变（1+1D），另外4%为沉默型携带者，即有两个SMN1拷贝，但都位于同一条染色体上（2+0）。目前qPCR、MLPA等传统基因检测方法无法检测1+1D和2+0携带者，残余风险最高可达1/415（1/1245-1/415）。
而三代测序具有超长读长、无GC偏好、对高度重复等复杂区域也能够准确测序等技术优势，且技术成本持续下降，2025年将实现与二代测序成本持平。在此基础上，贝瑞基因开发出三代SMA基因全面检测技术，全球首次实现SMN1及SMN2基因近30kb全长序列的高效率三代HIFI测序。CASMA还能同时检测SMN1及SMN2基因拷贝数、全基因范围内致病性SNVs及Indels，并主动提示沉默型“2+0”的携带风险。
此次三代SMA回顾性临床研究显示，CASMA一次性精准检测所有337例样本的SMN1及SMN2基因拷贝数，对SMN1拷贝数缺失的检测灵敏度高达100%。CASMA还成功检测出4例会被qPCR、MLPA等传统方法漏检的SMN1基因点突变携带者（1+1D）。通过专利分析方法，CASMA直接预测出全部7例（来自4个家系）已知“2+0”型携带者。数据显示，CASMA能大大改善SMA患者基因诊断及预后判断，提高SMA新生儿基因筛查效率，将携带者检出率从91-94%提高到98%以上，将残余风险降低4-5倍。
下一站场景，一键解决单基因全病种检测
事实上，三代SMA只是贝瑞基因三代测序临床转化体系中的一块拼图。不久前，由贝瑞基因提供技术支持的三代CAH（先天性肾上腺皮质增生症）临床回顾性研究成果，发表于检验医学领域权威国际学术期刊Clinical Chemistry（即时IF=11.784）。更早一些，2021年上半年，公司发起了地中海贫血基因图谱（TiGA）计划。2021年7月，由贝瑞基因提供技术支持的三代地贫多中心临床前瞻性研究成果在*The Journal of Molecular Diagnostics *上发表。
此外，贝瑞基因还有21台 PacBio Sequel II/IIe 三代测序仪储备，目前公司已将三代测序技术触达多种罕见病，包括三代地贫、三代CAH、三代SMA等产品相继落地。其中，三代地贫检测试剂盒近期取得医疗器械注册伦理批件，进入临床试验阶段。三代CAH和三代SMA技术则在2022年取得发明专利证书。
贝瑞基因三代事业部总监任志林接受钛媒体采访时表示：“把三代测序技术用在生殖健康领域、以及出生缺陷防控领域，在我们这样一个人口基数非常庞大的国家是很有价值的，有临床的实用性和前瞻性，而且我们也能想到这些遗传病不只是中国人的问题，实际上是全球的问题。”
对于三代测序的下一站应用场景，“一键解决”单基因全病种检测是贝瑞基因的目标。贝瑞基因介绍，因为公司的各种产品是高度兼容，所以更容易实现一次性解决多种疾病，而从一到多，准确性不会受到影响。（首发钛媒体，作者|张海霞，编辑|崔文官）
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